Genomanalysen spielen eine wichtige Rolle in der Krebsforschung. Variationen im menschlichen Genom (so genannte Mutationen) können die Wahrscheinlichkeit für bestimmte Krebserkrankungen erhöhen. Das, vom normalen Genom abweichende, Genom der Krebszellen kann Rückschlüsse über die Aggressivität des Krebs, oder die Effektivität der Behandlung zulassen. Personalisierte Krebsbehandlungen basierend auf einer genetischen Analyse können demnach Therapieentscheidungen unterstützen und Nebenwirkungen der Behandlung minimieren, ohne den Behandlungserfolg zu beeinträchtigen. 

Studien im Gebiet der Krebsforschung machen einen großen Teil der generierten Omicsdaten aus; zum Beispiel haben 55% der auf EGA gespeicherten 7PB Daten einen Bezug zur Krebsforschung. Es wird erwartet, dass Krebs, gemeinsam mit der Forschung über seltene Erkrankungen, in der nahen Zukunft die Generierung von Genomdaten dominieren wird. Stetig weiterentwickelte Sequenziermethoden und sinkende Kosten führen zusätzlich dazu, dass die Genomsequenzierung zunehmend routinemäßig in der Diagnostik angewendet wird. 

Langfristig möchte GHGA selbstverständlich Daten aus sämtlichen medizinischen Forschungsgebieten erhalten, jedoch werden wir uns aus den oben genannten Gründen vorerst auf die Forschungsgebiete Krebs und seltene Erkrankungen fokussieren. GHGA wird nicht nur unbearbeitete Datensätze annehmen, sondern zusätzlich Referenzdatensätze generieren. Diese Referenzdatensätze, sowie Fachgebiet-spezifische Zugangsportale werden die Nützlichkeit der GHGA Daten für Forschende und Kliniker:innen sicherstellen, welche wiederum die Zukunft von GHGA mitentwickeln werden.

Hier sammeln wir relevante Materialien für die Krebs-Forschungsgemeinschaft, wie zum Beispiel Anwendungsbeispiele, Neuigkeiten und Veranstaltungen.

Neuigkeiten zu GHGA und Krebsforschung

Neue Podcastfolge "Patientenbeteiligung: mit Betroffenen für Betroffene"

Patientenbeteiligung kann die medizinische Forschung und die Gesundheitsversorgung auf die Bedürfnisse der Patient*innen zuschneiden. In dieser Folge erzählt Anne Müller von ihren Erfahrungen.

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Benchmarking der genomischen Variantenbestimmung

In einer aktuellen Veröffentlichung stellen das Next Generation Sequencing Kompetenznetzwerk (NGS-CN) und GHGA gemeinsam NCBench vor – eine Plattform für das kontinuierliche Benchmarking der Bestimmung von genomischen Varianten.

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GHGA Metadaten-Modell Version 1.0 und Positionspapier veröffentlicht

Mit der Überarbeitung des GHGA Metadatenmodells auf Version 1.0 haben wir ein Positionspapier veröffentlicht, das die Entwicklung des Modells zusammenfasst und den Modellierungsrahmen im Detail beschreibt.

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Geplante Veranstaltungen

GHGA Vorlesungsreihe: Alexander Sczyrba (virtuell)

Alexander Sczyrba vom Universität Bielefeld wird über "Die de.NBI Cloud - Computing for Life Sciences" sprechen. Jetzt anmelden!

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